La organización de la Fundación Oxígeno esta formada por el Patronato que es el órgano de gobierno, representación y administración de la Fundación, el cual esta compuesto por los siguientes patronos:
Presidente, Vicepresidente, Secretario y dos vocales.
A su vez, cuenta con una Oficina Tecnica, la cual formada por un equipo de profesionales, tratan de llevar adelante y a cabo los fines para los cuales esta fundada y creada la Fundación Oxigeno.